通过conda安装纯净环境的inferCNV

发布于 2022-02-28  137 次阅读


  • conda create -n rinferCNV -c conda-forge r-base=4.1.2 -y
  • conda activate rinferCNV
  • conda install -c conda-forge r-seurat=4.1.0 -y
  • conda install -c conda-forge r-irkernel=1.3 -y
  • conda install -c conda-forge jags=4.3.0 -y
  • conda install -c conda-forge r-rjags=4_12 -y
  • conda install -c conda-forge python=3.9.10 -y
  • conda install -c conda-forge r-biocmanager=1.30.16 -y
  • BiocManager::install("infercnv")
  • IRkernel::installspec(name='rinferCNV', displayname='r-inferCNV')
  • https://github.com/harbourlab/uphyloplot2
  • unzip uphyloplot2-master.zip


一枚爱好探索的医学生