发布于 2022-10-02 Docker:部署数据科学栈Jupyter 66 热度 啥也没有呀 单细胞 持久化镜像存储 version: '3.3' services: datascience-notebook: …
发布于 2022-09-27 使用Bootstrap法计算自举置信区间 66 热度 啥也没有呀 统计学 计算药物LD50用Bliss法最严谨,而改良寇氏法计算的结果误差也不大,因此做了一次改良寇氏法计算LD50的实验。最后需要计算一下 …
发布于 2022-09-19 使用JTK_CYCLE算法分析生物节律 135 热度 啥也没有呀 时间序列 JTK是一种非参数检测程序,能从芯片数据中检测循环转录本。除了计算每个转录本最佳的相位(LAG)、振幅(AMP)和周期(PER)外 …
发布于 2022-09-13 R解决导出PDF时的字体问题 72 热度 啥也没有呀 绘图 安装包 conda activate clusterprofiler conda install -c conda-forge r …
发布于 2022-09-11 蛋白质组RPPA抗体与基因信息映射 100 热度 啥也没有呀 数据清洗 之前通过TCGAbiolinks下载了蛋白质组数据,而其中peptide_target给的是抗体的名字,进行富集时需要进行ID转换 …
发布于 2022-09-10 TCGAbiolinks下载蛋白质组数据 101 热度 啥也没有呀 数据库 之前通过tcpa下载过蛋白数据,而TCGAbiolinks也有下载蛋白质组学数据的示例,后者看上去更全面一点。 下载数据 libr …
发布于 2022-09-10 使用MICE包对数据缺失值进行插补 156 热度 啥也没有呀 数据清洗 在分析数据集时,常常会碰到一些缺失值,如果缺失值的数量相对总体来说非常小,那么直接删除缺失值就是一种可行的方法。但某些情况下,直接 …
发布于 2022-09-10 TCGAbiolinks下载甲基化数据(续) 151 热度 啥也没有呀 数据库 之前TCGAbiolinks下载甲基化数据的hg19的数据下载好了,现在继续进行分析 安装包 conda create -n rG …
发布于 2022-09-10 绘制富集系统聚类图(简化版) 99 热度 啥也没有呀 绘图 之前用GOplot绘制了富集系统聚类图,感觉非常好看也非常实用,因此简化一下调用流程 f_GOplot <- functio …
发布于 2022-09-09 火山图美化 98 热度 1 评论 绘图 用DESeq2计算的结果,有时候绘图时,会发现有些差异基因的P值为0,这时候可以通过使用其他方法来计算P值,代替为0的p值,在不改 …