数据库 – 璃墨的小站

发布于 2022-09-10

之前通过tcpa下载过蛋白数据，而TCGAbiolinks也有下载蛋白质组学数据的示例，后者看上去更全面一点。下载数据 libr …

发布于 2022-09-10

之前TCGAbiolinks下载甲基化数据的hg19的数据下载好了，现在继续进行分析安装包 conda create -n rG …

发布于 2022-09-09

安装补充包 conda activate tcga # conda install -c bioconda bioconducto …

发布于 2022-09-08

下载Gene水平的数据 library(TCGAbiolinks) query <- GDCquery( project = …

发布于 2022-09-06

下载数据 ~/dev/xray/xray -c ~/etc/xui2.json & library(TCGAbiolink …

发布于 2022-09-05

数据下载，从cBioPortal 从cBioPortal找到相应的数据，并从github下载 ~/dev/xray/xray -c …

发布于 2022-09-05

获取数据进入TCPA的下载页面选择感兴趣的L4数据 unzip TCGA-PRAD-L4.zip 清洗数据 f_dedup_IQ …

发布于 2022-09-04

安装包 conda create -n oncoPredict -c conda-forge r-base=4.1.3 conda …

发布于 2022-09-04

Connectivity Map（Cmap）为一个基因表达数据库，由哈佛、剑桥大学和麻省理工学院研究人员构建，利用不同干扰物（包括 …

发布于 2022-09-03

UCSC Xena是一个集分析、可视化、数据集下载等功能的在线数据分析和可视化平台。现有142个队列的1604个公共数据集包括T …