发布于 2022-09-27 使用Bootstrap法计算自举置信区间 66 热度 啥也没有呀 统计学 计算药物LD50用Bliss法最严谨,而改良寇氏法计算的结果误差也不大,因此做了一次改良寇氏法计算LD50的实验。最后需要计算一下 …
发布于 2022-08-20 生存数据计算C指数并进行比较 75 热度 啥也没有呀 统计学 安装补充包 conda activate ggsurvplot conda install -c bioconda biocond …
发布于 2022-08-19 COX-Ridge:外部数据集验证 97 热度 啥也没有呀 统计学 建模 library(glmnet) library(survival) df1 <- readRDS(‘../../fig ̷
发布于 2022-08-11 使用替换系数法使coxnet-lasso兼容coxph的分析 88 热度 啥也没有呀 绘图 目前R中用于构建LASSO模型的包主要是glmnet,当我们确定λ后,该如何画列线图、森林图等常规COXPH回归常用的可视化方法呢 …
发布于 2022-08-11 比较两个COXPH模型的性能 107 热度 啥也没有呀 绘图 安装补充包 conda activate ggsurvplot install.packages(‘survIDINRI’) 构建
发布于 2022-08-10 COXPH绘制ROC曲线 97 热度 啥也没有呀 绘图 安装补充包 conda activate ggsurvplot # conda install -c conda-forge r- …
发布于 2022-08-10 COXPH的变量筛选 88 热度 啥也没有呀 统计学 返工的血泪教训,单因素COXPH做完显著是不够的,此时应该再来一次多因素COXPH,剔除那些不具有独立预后能力的变量。 libra …
发布于 2022-08-10 LASSO回归:使用L1正则化控制过拟合 89 热度 啥也没有呀 统计学 安装补充包 conda activate ggsurvplot conda install -c conda-forge r-gl …
发布于 2022-08-08 将多数据集转化成无依赖的数据格式,进行单变量COXPH,并进行RRA整合 97 热度 啥也没有呀 数据库 PCaDB f_dedup_IQR ano <- readRDS('../../DEG/PCaDB/PCaDB_G …
发布于 2022-07-30 使用limma包进行差异基因分析 156 热度 啥也没有呀 统计学 虽然现在已经是高通量测序的时代,大家基本都是从counts矩阵出发,使用DESeq2进行差异表达分析,但是GEO和ArrayExp …