通过UCSC下载TCGA甲基化数据

UCSC Xena是一个集分析、可视化、数据集下载等功能的在线数据分析和可视化平台。 现有142个队列的1604个公共数据集包括TCGA, ICGC, TARGET, GTEx, CCLE等,不同的数据集之间精不同的标准化方法可以相互比较。(陈浩

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methy <- read.table( gzfile("TCGA.PRAD.sampleMap%2FHumanMethylation450.gz"), header = T, row.names = 1)
saveRDS(methy, 'methy_PRAD.rds')

通过UCSC下载TCGA甲基化数据
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Author
Limour
Posted on
September 3, 2022
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