流程：https://docs.gdc.cancer.gov/Data/Bioinformatics_Pipelines/Expression_mRNA_Pipeline/ 第一步 安装必要的软件 conda create -n star -c bioconda star -y conda activate star conda install -c bioconda sam

第一步 读取数据123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445library(Seurat)library(plyr)library(dplyr)library(patchwork)library(purrr)f_metadata_removeNA <- function(sO

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血细胞由造血器官产生，人胚胎时期的卵黄囊、肝、脾、胸腺和骨髓等器官均具有造血功能，出生后，红骨髓是主要的造血器官。 血岛是人类胚胎最早形成血细胞的场所：人胚第三周，卵黄囊壁等处的胚外中胚层细胞团聚而成血岛，开始出现原始的造血干细胞，但仅能向红细胞系分化造血，称为原始造血或胚胎造血。 人胚第6周初，造血干细胞随血流迁移至肝，肝开始造血。 第9~20周，胎肝是体内主要的造血场所。脾造血也于胚胎第

胚系基因的结构TCR胚系基因 免疫球蛋白胚系基因 胚系基因重排TCR基因重排 免疫球蛋白基因重排 胚系基因重组与连接RSS（重组信号序列） 一些位于Ig 和 TCR可变区基因片段外显子旁侧、与可变区基因片段重排有关的 DNA序列 RSS包括一个高度保守的、具有回文结构的7核苷酸序列（heptamer，CACAGTG），总是紧邻V、D和J基因的外显子 两者之间、非保守的 12或 23碱基对（bp）间

外源性抗原肽通过MHCII呈递，内源性抗原通过MHCI呈递，此外还有交叉呈递和脂类抗原的提呈途径 交叉提呈途径 APC将外源性抗原通过MHCI类分子途径提呈给CD8＋T细胞 从晚期内体／吞噬溶酶体溢出进入胞质／直接进入胞质 晚期内体／吞噬溶酶体中形成的抗原肽胞吐出胞、和膜表面的空载MHCI类分子结合而被提呈 细胞表面MHCI类分子被重新内吞进入内体／新合成的MHCI类分子进入内体，直接和外源

适应性免疫的激活离不开抗原。抗原是能被TCR和BCR特异性识别，促使抗原特异性T、B细胞活化、增殖和分化，产生免疫应答效应产物，并与之结合，进而发挥适应性免疫应答效应的物质。其有两个重要且独立的特性：免疫原性和抗原性（免疫反应性）。 免疫原性：诱导适应性免疫应答的能力 抗原性：与免疫效应产物结合的能力 不具有免疫原性的小分子半抗原可以是大分子蛋白质载体共价结合获得免疫原性。（青霉素与血浆蛋白、

环境中的病原体侵入生物机体后，胞外菌寄居在宿主的细胞外组织液、淋巴液和血液等体液中。侵入的病原体会刺激特异性B细胞活化并分化为浆细胞。根据B细胞对Ag的反应，将Ag分为TI－Ag（胸腺非依赖性抗原）和TD－Ag（胸腺依赖性抗原）。活化的B细胞通过产生抗体来发挥效应。 TI－Ag该类抗原刺激机体产生抗体无需T细胞的辅助，可以分为TI－1Ag和TI－2Ag。 TI－1Ag 既有抗原表位又有丝裂原性